Начало аниме переносит нас в Соединенное Королевство Великобритании и прекрасный ночной город Лондон, где, пока не известная нам чародейка по-имени Анжелика, готовит посылку нашей главной героине. Героиню зовут Хатори Чисэ. До событий данного аниме у неё была дюже жестокая жизнь. Мать покончила жизнь самоубийство, так как не могла принять столь странное дитя. А Чисэ в глазах окружающих была именно такой. Она видела странных существ, которые для неё были омерзительными и вызывали холодный пот по спине. Будь то обычный завтрак, прогулка, беседа с кем-то, эти существа не просто были в дали от неё, они всячески мешали ей жить, вводя Чисэ в еще больший ужас.
Люди, которые пытались проявлять к ней заботу, в итоге впадали в истерику, ибо они так же как и мать Чисэ, не понимали что с ней происходит. Однажды она просто сбегает ото всех в лес, где находит удивительное для себя место. Здание, которое внутри представляло из себя огромную библиотеку и человек, единственный кто понял, что с Чисэ не так. Он сказал, что существа, которых она видит, не могут проникнуть в это места, а сам он являлся хранителем леса, чтобы это не значило. Так Чисэ наконец-то удалось обрести душевный покой, а впереди её ждали необычайные приключения.